證書載明上的區別
（1）醫療器械經營許可證載明許可證編號、企業名稱、法定代表人、企業負責人、住所、經營場所、經營范圍、庫房地址、發證部門、發證日期和有效期限等事項；
（2）醫療器械經營備案憑證載明編號、企業名稱、法定代表人、企業負責人、住所、經營場所、經營方式、經營范圍、庫房地址、備案部門、備案日期等事項。
有效期的區別
（1）醫療器械經營許可證的有效期為5年。
（2）醫療器械經營備案憑證有效期永久使用。
申請條件的區別
（1）醫療器械經營許可證載明許可證編號、企業名稱、法定代表人、企業負責人、住所、經營場所、經營范圍、庫房地址、發證部門、發證日期和有效期限等事項；
（2）醫療器械經營備案憑證載明編號、企業名稱、法定代表人、企業負責人、住所、經營場所、經營方式、經營范圍、庫房地址、備案部門、備案日期等事項。
有效期的區別
（1）醫療器械經營許可證的有效期為5年。
（2）醫療器械經營備案憑證有效期永久使用。
申請條件的區別
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